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生物安全防護水平為一級的實驗室適用于操作在通常情況下不會引起人類或者動物疾病的微生物。一級生物安全實驗室的操作、安全設備和實驗設施的設計和建設僅適用于進行基礎的教學和研究，處理危害等級1的微生物。BSL-1是生物安全防護的基本水平，依靠標準的微生物操作來保證安全，缺少特殊的一級防護屏障或二級防護屏障。一般來說，一級生物安全實驗室僅能從事沒有感染性的操作，不能滿足食品微生物檢測實驗室的工作需要。
一級生物安全實驗室需滿足如下設施和設備的要求：實驗室的門應有可視窗并可鎖閉，門鎖及門的開啟方向應不妨礙室內人員逃生。應設洗手池，宜設置在靠近實驗室的出口處：實驗室門口處應設存衣或掛衣裝置，可將個人服裝與實驗室工作服分開放置。實驗室的墻、天花板和地面應易清潔、不滲水、耐化學品和消毒滅菌劑的腐蝕。地面應平整、防滑，不應鋪設地毯。實驗室臺柜和座椅等應穩固，邊角應圓滑。實驗室臺柜等和其擺放應便于清潔，實驗臺面應防水、耐腐蝕、耐熱和堅固。實驗室應有足夠的空間和臺柜等擺放實驗室設備和物品。應根據工作性質和流程合理，放實驗室設備、臺柜、物品等，避免相互干擾、交叉污染，并應不妨礙逃生和急救。實驗室可以利用自然通風。如果采用機械通風，應避免交叉污染。如果有可開啟的窗戶，應安裝可防蚊蟲的紗窗。實驗室內應避免不必要的反光和強光。若操作刺激或腐蝕性物質，應在30 m內設洗眼裝置，必要時應設緊急噴淋裝置。若操做有毒、刺激性、放射性揮發物質，應在風險評估的基礎上，配備適當的負壓排風柜。若使用高毒性、放射性等物質，應配備相應的安全設施、設備和個體防護裝備，應符合國家、地方的相關規定和要求。若使用高壓氣體和可燃氣體，應有安全措施，應符合國家、地方的相應規定和要求。應設應急照明裝置。應有足夠的電力供應。應有足夠的固定電源插座，避免多臺設備使用共同的電源插座。應有可靠的接地系統，應在關鍵節點安裝漏電保護裝置或監測報警裝置。供水和排水管道系統應不滲漏，下水應有防回流設計。應配備適用的應急器材，如消防器材、意外事故處理器材、急救器材等。應配備適用的通訊設備。必要時，應配適當的消毒滅菌設備。
二、二級生物安全實驗室
生物安全防護水平為二級的實驗室適用于操作能夠引起人類或者動物疾病，但一般情況下對人、動物或者環境不構成嚴重危害，傳播風險有限，實驗室感染后很少引起嚴重疾病，并且具備有效治療和預防措施的微生物。二級生物安全實驗室的操作、安全設備和實驗設施的設計和建設適用于臨床、診斷、教學，處理危害等級II的微生物。
BSL-2實驗室的危險主要是意外的經皮膚或黏膜接觸或攝入生物危險物質，需使用生物安全柜進行防護。BSL-2實驗室有比較齊全的一級屏障，例如個人防護裝備，也有廢棄物消毒設施等二級屏障來保正安全。對于廣大食品微生物檢測實驗室，一般都要開展沙門氏菌、金黃色葡萄球菌等危害等級II的致病微生物的檢測工作，需要達到二級生物安全實驗室的防護水平。
二級生物安全實驗室的設施和設備要求除要達到一級生物安全實驗室的要求外，還要滿足：實驗室主入口的門、放置生物安全柜實驗間的門應可自動關閉；實驗室主入口的門應有進入控制措施。實驗室工作區域外應有存放備用物品的條件。應在實驗室工作區配備洗眼裝置。應在實驗室或其所在的建筑內配備高壓蒸汽滅菌器或其他適當的消毒滅菌設備，所配備的消毒滅菌設備應以風險評估為依據。應在操作病原微生物樣本的實驗間內配備生物安全柜。應按產品的設計要求安裝和使用生物安全柜。如果生物安全柜的排風在室內循環，室內應具備通風換氣的條件；如果使用需要管道排風的生物安全柜，應通過獨立于建筑物其他公共供通風系統的管道排出。應有可靠的電力供應。必要時，重要設備(如：培養箱、生物安全柜、冰箱等)應配置備用電源。
